MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021881	TAC	2	6	607868	607873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021881	CT	3	6	607889	607894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_021881	ATATT	2	10	607899	607908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021881	AGC	2	6	610660	610665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021881	TTC	2	6	610713	610718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021881	TGT	2	6	610726	610731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021881	TAT	2	6	610792	610797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021881	ATG	2	6	610804	610809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021881	AT	3	6	610820	610825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021881	T	6	6	610832	610837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021881	AGG	2	6	610882	610887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021881	T	7	7	611049	611055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021881	TAAA	2	8	611057	611064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021881	TTTTTA	2	12	611084	611095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021881	T	6	6	611124	611129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021881	TAC	2	6	611171	611176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021881	TGTA	2	8	611240	611247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021881	T	6	6	611252	611257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021881	CA	3	6	611363	611368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_021881	AT	3	6	611372	611377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021881	TC	3	6	611412	611417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_021881	AGAA	2	8	611472	611479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021881	TAT	2	6	611485	611490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021881	CAG	2	6	611498	611503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_021881	TTCT	2	8	611563	611570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_021881	AC	3	6	611624	611629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_021881	TTA	2	6	612362	612367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021881	T	7	7	612402	612408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021881	AT	3	6	612422	612427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021881	TA	3	6	612470	612475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021881	AT	4	8	612500	612507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021881	CCG	2	6	612535	612540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_021881	GCT	2	6	612939	612944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021881	T	6	6	612995	613000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021881	TGTT	2	8	613033	613040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021881	GCGG	2	8	613076	613083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_021881	TGCT	2	8	613155	613162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_021881	TAG	2	6	613171	613176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021881	TTA	2	6	613464	613469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021881	GA	3	6	613491	613496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021881	ATG	2	6	613593	613598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021881	TTA	2	6	613623	613628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021881	GAT	2	6	613630	613635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021881	AT	3	6	613634	613639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021881	AGA	2	6	613679	613684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021881	AGC	2	6	613690	613695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021881	CTG	2	6	613714	613719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021881	TA	3	6	613721	613726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021881	TCGCT	2	10	613752	613761	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3050	NC_021881	ATT	2	6	613785	613790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021881	ATG	2	6	613842	613847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021881	TTAG	2	8	613929	613936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021881	TTA	2	6	613996	614001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021881	TAC	2	6	614024	614029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021881	TG	3	6	614059	614064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021881	AGTA	2	8	614101	614108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021881	GTACA	2	10	614195	614204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_021881	CA	3	6	614215	614220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_021881	GT	3	6	614225	614230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021881	AT	3	6	614236	614241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021881	TCT	2	6	614246	614251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_021881	ATA	2	6	614255	614260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021881	AGA	2	6	614270	614275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021881	TTTA	2	8	614280	614287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021881	AT	3	6	614298	614303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021881	TAG	2	6	614907	614912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021881	AT	3	6	614937	614942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021881	AGA	2	6	614943	614948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021881	TAGGTA	2	12	614999	615010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021881	T	6	6	616478	616483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021881	TGG	2	6	616496	616501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021881	TA	3	6	616508	616513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021881	ATG	2	6	616531	616536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021881	CTTT	2	8	616592	616599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_021881	TA	3	6	616639	616644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021881	CAG	2	6	616646	616651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_021881	ATT	2	6	616729	616734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021881	A	7	7	616902	616908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021881	TAG	2	6	616963	616968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021881	A	6	6	617054	617059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021881	GGGAA	2	10	617206	617215	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021881	TAG	2	6	617223	617228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021881	T	6	6	617300	617305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021881	TA	3	6	617322	617327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021881	TCC	2	6	617418	617423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_021881	TGC	2	6	617441	617446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021881	TAT	2	6	617458	617463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021881	AGTTT	2	10	617489	617498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021881	AGT	2	6	617737	617742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021881	GT	3	6	617741	617746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021881	ACTC	2	8	617916	617923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_021881	T	7	7	617929	617935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021881	ATAG	2	8	617950	617957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021881	CCT	2	6	618001	618006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_021881	CAA	2	6	618037	618042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021881	TTC	2	6	618053	618058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_021881	CTT	2	6	618078	618083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021881	TC	3	6	618108	618113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_021881	GAA	2	6	618131	618136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021881	ATCTG	2	10	618179	618188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3103	NC_021881	AAT	2	6	618251	618256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021881	AT	3	6	618262	618267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021881	ATTCA	2	10	618933	618942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3106	NC_021881	CATG	2	8	618958	618965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_021881	GGT	2	6	618968	618973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021881	T	6	6	618987	618992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021881	CTA	2	6	619115	619120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021881	GAT	3	9	619126	619134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021881	ACT	2	6	619629	619634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021881	TA	3	6	619682	619687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021881	CTT	2	6	619704	619709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021881	ATT	2	6	619753	619758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021881	T	7	7	619757	619763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021881	AAT	2	6	619773	619778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021881	GTT	2	6	619902	619907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021881	AGA	2	6	622357	622362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021881	CT	3	6	622423	622428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_021881	CTG	2	6	622441	622446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_021881	TTATA	2	10	622474	622483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021881	CT	3	6	622489	622494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_021881	GAA	2	6	622549	622554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021881	CT	3	6	622602	622607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_021881	CT	3	6	622654	622659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_021881	TCT	2	6	622720	622725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_021881	TGTT	2	8	622756	622763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021881	ATGC	2	8	622881	622888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_021881	CGT	2	6	622901	622906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_021881	A	6	6	622938	622943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021881	GCA	2	6	622945	622950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_021881	CAG	2	6	622971	622976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021881	GCA	2	6	623002	623007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021881	CAT	3	9	623037	623045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_021881	CTT	2	6	623054	623059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_021881	TAC	2	6	623150	623155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_021881	ATGC	2	8	623196	623203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_021881	CGT	2	6	623220	623225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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